Bioconda

Bioconda是专门从事生物信息学软件的Conda封装管理器的频道。

Bioconda依赖于Conda环境,Conda安装见使用Conda搭建Python学习环境及常用命令

Bioconda 安装

添加源

添加官方bioconda源或者清华bioconda源

conda config --add channels bioconda
conda config --add channels http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/

创建Bioconda虚拟环境

conda create -n bioconda python=3.7

Bioconda虚拟环境安装RPerl

conda install -c r r
conda install perl

安装R包,就在名字前加r-,比如r-string

Biopython 安装

Bioconda虚拟环境安装Biopython

conda install biopython

参考链接:
Biopython · Biopython
Biopython Github
Bioconda
Bioconda Github
bioRxiv.org - the preprint server for Biology

Last modification:February 18th, 2020 at 12:05 pm
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